1886. Auf den Weltmeeren herrscht Angst und Schrecken. Ein unbekanntes unterseeisches Objekt attackiert die vorbeifahrenden Schiffe. Der junge Meeresforscher Pierre Arronax glaubt, dass ein riesiger Wal für die Angriffe verantwortlich sei. Sein Vater, ebenfalls ein anerkannter Forscher, glaubt nicht an ein zoologisches Wesen. Es kommt zum Zwist zwischen den beiden. Pierre bricht zu einer gefährlichen Forschungsreise auf. Zusammen mit seinem Bekannten, dem farbigen Cabe Attucks, jagen sie auf der Fregatte "Abraham Lincoln" dem mysteriösen Objekt hinterher. Auf See kommt es nach kurzer Zeit tatsächlich zum Zusammentreffen mit dem vermeintlichen Ungeheuer. Als Arronax zusammen mit seinem Freund und dem Walharpunier Ned Land über Bord geschleudert werden, fassen sie Fuß auf metallischen Boden. Dies ist der Anfang einer unglaublichen Unterseereise und die Geschichte des Kapitän Nemo und seiner "Nautilus"...